华中科技大学同济医学院附属协和医院有病理工作档案记载自1959年开始，诊断工作之初依托武汉医学院病理教研室（后更名为华中科技大学同济医学院病理系）完成。1988年因工作需要，医院开始组建独立的病理科。建科初期有医师2名，技术员5名。经过30余年的努力与沉淀，病理科获得快速发展，现有职工93名，其中医师及医师助理53名，技术及辅助人员40名。一人荣获“中国病理事业突出贡献专家”，一人荣获“中国杰出青年病理医师奖”。科室集医、教、研为一体，为国内住院医师规范化培训示范基地，国家病理质控中心（PQCC）示范实验室，湖北省早批远程病理会诊试点中心，湖北省卫生计生委改善医疗服务行动计划示范科室。2019年通过CNAS医学实验室ISO15189认可，为全国第九家，湖北省较早的一家通过认可的病理科。

病理科承担全院所有科室送检的组织及细胞病理检查，设有乳腺、淋巴造血系统、女性生殖系统、骨、软组织、泌尿及男性生殖系统、头颈疾病、消化系统、胸部疾病、中枢神经系统、皮肤、心血管、儿科、内分泌、移植、细胞病理及分子病理等17个亚专科。科室拥有先进的空气通风净化系统和全套现代化的仪器设备，建有标准化分子病理实验室，荧光原位杂交、实时荧光定量PCR、数字PCR、Illumina高通量测序及Life高通量测序等分子病理检测平台齐全。完成组织、脱落细胞及血液的病理诊断，针对遗传性疾病、感染性疾病和肿瘤性疾病的早期诊断、鉴别诊断、靶向治疗及药物药效预测开展了基因检测项目。病理科始终坚持以医疗质量为中心，实施全员参与质控管理的理念，通过十年积累，建立了68万字的“协和模式”质量管理制度体系，255个环节采用表格式清单管理，实现管理的全流程信息化、可溯化和精细化。年常规外检量近11万例，承担外院疑难切片会诊近1万例，术中快速切片诊断1.2万例。

科室近五年获得国家自然科学基金资助项目9项，省级自然科学基金资助项目3项，中央高校基本科研业务费专项资金1项，承担科技部“公共安全风险防控与应急技术”重点专项子课题。近五年以第一作者或通讯作者发表 SCI 论文33篇，IF>5 分的文章10篇，其中一篇发表于《Cell》杂志。

病理科承担临床医学五年制病理实习教学及医学检验系本科教学，招收博士、硕士研究生及留学生，注重毕业后教育及继续教育工作。2020年，科室毕业后教育在医院评比中排名较前。自2008年起每年主办以亚专科新的进展为主题的省级及国内继教项目，连续举办13年，发挥教学医院区域示范带头作用。积极拓展对外合作与交流，建立与世界著名医疗机构的国际合作和交流，2016年建立与约翰霍普金斯医学院的国际远程疑难病理会诊平台。科室多人在国际高等高校和科研机构访问学习。