临床检验部由珠江新城院区检验科、儿童院区检验科、妇婴院区检验科、增城院区检验科和病理科组成。工作场地超3000m2，开展检测项目400余项，年检测量800余万次，是广东省妇幼保健协会检验分会主委单位，广东省检验医师协会和广东省行业协会副主委单位，是早批国家检验医学专业住院医师规范化培训基地以及早批国家卫生健康委能力建设和继续教育中心检验医学进修与培训基地。

临床检验部有正高职称11名，副高职称20名，博士生导师2名，硕士生导师3名，广东省杰青1名，广州市医学重点人才2名。2013年通过ISO15189认证，已具备了国际标准的管理与技术水平，实现了实验室标准化、规范化建设和全面质量控制。