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二者的区别主要是：
CT又叫电子计算机断层扫描，是利用X线在不同组织中的穿透力不同来构成与显示图象的。 特点是分辨率高，对颅内肿瘤、脓肿、寄生虫病、血肿与脑损伤、脑梗塞与脑出血以及椎管内肿瘤与椎间盘脱出等病能正确诊断。
SPECT简称ECT，是核医学的常规一项检查，是利用放射性药物在正常与异常组织器官内的分布不同来诊断疾病的，是先让人体接受某种放射性药物，再对脏器组织中的放射性核素的浓度分布和代谢进行成像。因此 ECT既可得到人体脏器的解剖图像，还可反映生理、代谢方面的改变，能较早地发现与诊断疾病。
