华西医院（West China Hospital）起源于美国、加拿大、英国等国基督教会1892年在成都创建的仁济、存仁医院；华西临床医学院起源于1914年的华西协合大学医科，是由美、加、英等国教会按西方医学教育模式建立的医学院。
　　1913年，华西协和大学在此基础上成立学院，并将两院作为医学院教学医院。
　　1937年，抗日战争全面爆发，中央大学、燕京大学、齐鲁大学、金陵大学、金陵女子文理学院内迁成都，与华西协合大学联合办学办医；是时，华西坝专家云集，名家汇萃，学术盛况空前。
　　1938年，有医学院的华大、中大、齐大组建联合医院。
　　1946年，华西协合大学医院在现址全部建成，简称华西医院。
　　1950年，新中国人民政府接管华西协合大学。
　　1953年，经院系调整为四川医学院，医院更名为四川医学院附属医院。
　　1985年，四川医学院更名为华西医科大学，医院更名为华西医科大学附属医院。
　　1993年，华西医院将企业财务管理的成本核算方法引入医院科室的经济核算工作，并将管理效果与科主任的任用和考核结合。
　　2000年，四川大学与华西医科大学合并，学院/医院更名为四川大学华西临床医学院/华西医院。
　　2005年，在卫生部医院管理年活动督导检查中，华西医院以优良的成绩通过考核。
　　2006年，医院党政班子明确了医院的战略定位：建设“疑难重症的国内高级诊疗中心、高等医学教育的国家示范基地、医学科学研究和技术创新的国内高级基地、以我院为中心的区域性健康维持网络”。
　　2017年11月11日，复旦大学医院管理研究所正式发布了《2016年度中国医院排行榜》和《2016年度中国医院专科声誉排行榜》。在入榜的100家医院中，北京协和医院、四川大学华西医院、中国人民解放军总医院继续名列前三