呼吸与危重症医学科始建于20世纪40年代，系我国建科较早的呼吸内科之一，早在20凝心聚力世纪四十年代即设立了呼吸科病房，时任公济医院院长朱仰高教授兼第一届肺科主任，1982积极创建全国文明单位年建立肺功能血气室，作为上海市血气质控中心使全市各级医院的血气分析规范化，并于九十年代初在全国较早建立了呼吸危重症监护病房，开展的有创序贯无创通气治疗技术全国领跑，成功救治了包括SARS，H1N1危重患者在内近干例各类危重症患者。

目前，呼吸与危重症医学科经过几代人的不断努力，已发展成为拥有正高职称6人，副高职称7人，博士学位16人，博士生导师3人，硕士生导师5人，肺功能气管镜技术人员10人，专科护士28人的专业技术核心团队；目前拥有住院床位70余张，重症监护床位8张。下设有现代化的呼吸病介入诊疗中心、肺功能检测室、睡眠呼吸监测室和专属临床转化实验室。

呼吸科于2011年被国家卫生部列为“国家临床重点建设专科”，并形成了特色鲜明、齐头并进的亚专科发展格局：在慢性气道疾病的精准化个体化管理策略驱动下，支气管哮喘诊治水平位居申康重点病种排名全市第一；应用创新介入技术结合一体化诊治策略的肿瘤与介入亚专科平台为众多患者争取了更高的生活质量和生存时间；以序贯呼吸支持治疗和病原学快速诊断技术为基石的感染与危重症综合诊治平台也大幅度提高了急危重症及疑难下呼吸道感染患者的救治成功率。科室老中青骨干力量分别在抗击SARS和新冠疫情的工作中做出了突出贡献，多次获得国家和省市级表彰。

呼吸与危重症医学科近年来承担国家自然基金项目十余项，国家中医药管理局科研项目、“十一五”和“863”重大课题子项目，上海市科委和卫生局课题三十余项，获国家发明及实用新型专利20余项，上海市优秀发明奖3项，“支气管哮喘的基础研究和规范化诊治”获2012年国家科技进步二等奖（合作单位），上海医学科技进步三等奖。连续多年举办呼吸系统疑难疾病诊治新进展国内医学继续教育培训班，在国内外发表学术论文200余篇，主编专著20余部。

呼吸与危重症医学科作为上海交通大学医学院呼吸系统整合教学知名单位获得上海高校市级重点课程立项，承担上海市交通大学医学院、南京医科大学五年制、七年制和八年制教学任务，培养博士研究生20余名，硕士研究生40余名，与英国、瑞典、美国等多个著名大学及知名研究所合作。取得国内市级奖项10余项，同时多人或国家和市级各级人才奖项。