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PETCT扫描速度快、成像质量好、辐射剂量低，在原发肿瘤寻找转移灶、转移瘤寻找原发灶、免疫性疾病、特殊感染性疾病、不明原因发热、缺血性心肌病等诊断中具有其他检查技术不可比拟的优势。
全身肿瘤领域：寻找原发灶和转移灶；鉴别良恶性肿瘤或病变；肿瘤分期与再分期；指导肿瘤的治疗方案；指导临床活检和制定生物靶区；疗效评估，鉴别肿瘤治疗后坏死、纤维化、残留或复发。
PETCT可以无创性定位癫痫灶，为脑外科手术、伽玛刀切除癫痫灶提供明确的手术范围；与创伤性的开颅皮层脑电图定位癫痫灶吻合率在90%以上。冠心病是冠状动脉粥样硬化导致心肌缺血缺氧的一种疾病。PETCT在冠心病诊断中发挥了重要作用，它可以通过功能代谢显像来评估冠状动脉的狭窄程度和心肌灌注情况。
