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PET-CT在肿瘤诊断方面有很多应用，很多肿瘤在PET-CT上代谢都会表现为增高。比如肺癌、乳腺癌、结直肠肿瘤，妇科卵巢癌、子宫内膜癌、宫颈癌、膀胱癌，这些代谢都可以增高，都可以运用PET-CT进行诊断。对于有些病变，可能PET-CT代谢并不是那么高，但是PET-CT检查时可以发现转移灶，也可以从另一方面进行诊断。
如果是肿瘤，PET-CT上表现为代谢增高，从图像上看出来是个浓点，产生浓点的原因是肿瘤细胞葡萄糖代谢比正常细胞葡萄蛋代谢要高，然后运用的显像剂是葡萄糖类似物，可以吸收更多葡萄糖，把肿瘤病灶表现出来。
目前PET-CT是医院里比较常见的大型仪器的检测设备，因为PET-CT是一个全身检查，现在还不普遍用于肿瘤的复查、筛查，因为价格比较昂贵。但该检查的精细准确度较高，对好多癌症，比如肺癌、前列腺癌、各种胃癌、肠癌、胆囊癌、胰腺癌，都可以做精细准确的检查。但是它因为价格昂贵，况且有些癌症早期或者常规的普通CT或者核磁都可以发现，所以好多医生专家不建议一发生癌症就做PET-CT检查，还是基础的检查为主，有必要的时候听取医生的建议，医生建议做再做。
