上海市中医文献馆成立于1956年，是上海市名老中医学术之家，于60年代初开设老中医门诊部。1990年又扩建成立了上海市中医药情报研究所，成为地方中医管理局在上海的信息分中心。1995年经上海市卫生局批准为上海市中医药信息协作中心基地。

本馆是上海市名老中医学术之家，是上海地区开展老中医学术思想继承、疑难病症的诊治和民间医药研究及交流的活动基地。“沪上多名医”，上海不但是远东主要的经济文化中心之一，而且是近代名医汇萃之地。本馆作为老中医学术之家，因此集中地反映了上海地区名老中医的高超水平。本馆的顾问、馆员中，如已故名中医顾谓川、张赞臣、顾攸岩、严苍山、姜春华、陈苏生、裘沛然，当今健在的张镜人、颜德馨、董廷瑶、钱伯文、李国衡、朱南荪等均为蜚声海内外的一代名医。上海市中医文献馆中医门诊部是全国较早继承老中医行为经验的门诊部，汇萃了上海市的中医名家，是治疗各种慢性疾病、疑难杂症的重要诊疗场所。