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先天性心脏病是先天性畸形中较常见的一类，约占各种先天畸形的28%，指在胚胎发育时期由于心脏及大血管的形成障碍或发育异常而引起的解剖结构异常，或出生后应自动关闭的通道未能闭合（在胎儿属正常）的情形。少部分先天性心脏病在5岁前有自己好的机会，另外有少部分患者畸形轻微、对循环功能无明显影响，而无需任何治疗，但大多数患者需手术治疗校正畸形。
复旦大学附属儿科医院的心内科创建于1956年，是国内较早的儿科三级学科之一，是集医、教、研一体的国内驰名的小儿心脏内科诊治中心。心内科包括病房、专科门诊、心导管室、超声心动图室、心电及心功能室。先天性心脏病是心内科诊治的主要疾病。1957年儿科医院在国内率先开展小儿心导管检查，1984年开始进行先天性心脏病介入治疗。目前常规开展先天性心脏病复杂畸形的心导管检查及心血管造影，为心外科手术提供精细准确的血流动力学评估。
先天性心脏病是我国新生儿和婴幼儿较主要的死亡原因，20％～30％的先天性心脏病患儿由于没有得到及时诊断和治疗，在出生后1年内因严重缺氧、休克、心力衰竭、严重肺炎、感染性心内膜炎等并发症而死亡。为帮助先天性心脏病患儿得到早期发现、早期诊断、及时治疗，复旦大学附属儿科医院黄国英教授团队建立了 “双指标法”，为出生后6~72小时的新生儿开展先天性心脏病筛查提供了“复旦儿科方案”，2016年6月该方案在上海全市范围内率先实施，形成了可复制推广的“上海经验”。
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