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1.上海瑞金医院呼吸内科：瑞金医院呼吸内科建于1952年，迄今已届70余年。科室长期从事呼吸系统疾病临床、科研和教学任务。
主任医师李庆云，擅长慢性阻塞性肺疾病，呼吸危重症救治，机械通气，支气管哮喘，呼吸道感染以及肺癌等。副主任医师包志瑶，擅长慢性气道疾病、肺部感染性疾病、肺癌等诊治。
2.上海中山医院呼吸内科：中山医院呼吸与危重医学科是由我国知名肺病学家、防痨事业奠基人之一吴绍青教授于上世纪30年代创立的肺科发展而来。也是国内较早建立的肺病学研究室。
主任医师邵长周，擅长肺部感染、肺真菌病、肺部肿瘤、肺部结节及阴影、咳嗽、哮喘、肺气肿及间质性肺病等常见肺部疾病的诊治。副主任医师姜红妮，擅长肺部感染、肺部占位性疾病、间质性肺病等诊治。
3.上海儿童医学中心呼吸内科：呼吸科主要从事0~18周岁儿童和青少年呼吸系统疾病的临床医疗、教学和科研工作。已形成儿童哮喘、慢性咳嗽、过敏免疫，感染免疫、睡眠障碍、气道狭窄、肺功能评估、呼吸罕见疑难病等亚专业，是国内亚专业种类较为齐全的团队之一。
副主任医师张磊，擅长儿科常见呼吸系统慢性疾病（慢性咳嗽、哮喘等）的治疗和管理，儿科常见呼吸系统感染性疾病（肺炎、支气管等）的规范化治疗，儿童疑难危重呼吸系统疾病诊治。副主任医师钟文伟，擅长儿童哮喘、慢性咳嗽、呼吸系统感染等儿童呼吸系统疾病的诊治。
