南昌大学第二附属医院普通外科建科于1927年，是伴随着南昌大学第二附属医院的前身——江西省省立外科医院诞生而诞生，是江西省较早开展外科学临床诊治及研究的专门医疗机构，是我省外科学的发源地，几乎我省所有新兴外科专业均由我科分出。我省第一台阑尾切除、胆囊切除、胃大部切除、门体分流、肝切除、胰十二指肠切除…原位肝移植、背驼式肝移植、再次肝移植、腹腔镜肝脏切除、解剖性肝（段）切除、经自然腔道内镜外科手术（NOTES）等均由我科完成。国内著名外科专家高茂山、杨仲达、胡献尚、黎学浚、李建业、林尊伟、余安国、陈安球、刘勇、盛茂鑫、谢敏、蒋筱强、傅华群、熊吉信等曾先后担任科室学科带头人。科室在建立后为江西省外科的普及、发展、提高作出了同道公认的杰出贡献。

  南大二附院普外科现任学科带头人为邵江华教授。目前，学科是江西省省级临床重点专科；江西省“十五”，“十一五”，“十二五”重点学科、高水平学科；其中肝胆外科、血管外科、甲状腺外科为江西省医学领跑学科；江西省卫生厅领跑学科省市共建项目援建单位；江西省医学学科省县共建项目援建单位。同时，江西省唯一的国家卫计委早批外周血管介入诊疗培训基地、江西省普通外科临床医学研究中心、江西省普通外科质量控制中心、江西省腹腔镜（普通外科）质量控制中心暨腹腔镜培训基地，江西省肝胆疾病工程技术研究中心、江西省肝胆外科疾病诊疗中心、南昌大学肝胆外科研究所均挂靠我科。

  学科现分五个科室，十个病区，分别为肝胆胰外科、胃肠外科、血管外科、甲状腺外科和乳腺外科，共有开放床位478张。2018年，我科门诊人次10万余人，住院人次达一万八千余人次，年手术量一万三千余台。