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上海长征医院是一所集医疗、教学、科研为一体的综合性三级甲等医院。医院具有骨科、神经外科、肾内科、泌尿外科、整形外科、急救科等六大传统优势学科，形成了器官移植、微创治疗、眼眶肿瘤治疗、肿瘤早期诊断与治疗、骨髓瘤及淋巴瘤诊断与治疗、睡眠障碍治疗、糖尿病及骨质疏松治疗、真菌病的诊断与治疗、外科伤病、颈动脉狭窄及大动脉瘤诊治等九大新兴医疗特色。
1、脊柱外科： 脊柱外科历经数辈人不懈努力，目前是骨科乃至全院规模很大的科室，也是国内这一专业的领头羊。自成立以来，始终坚持以"高度的责任心、精湛的技术水平"为患者解除病痛。目前形成了颈椎病、腰椎间盘突出症、腰椎管狭窄症、韧带骨化疾病、脊柱畸形（上颈椎畸形、青少年特发性脊柱侧弯、颈椎后突畸形、腰椎退变性侧弯）、脊柱结核、脊柱微创手术等多方面的医疗特色，均达到了世界优等水平。
2、神经外科：下设神外一科和神外二科2个亚学科，设有神经外科门诊、神经外科急诊、病房、NICU、神经介入中心、内镜颅底外科中心、颅神经疾病诊疗中心、脊髓脊柱中心、实验研究中心和神经康复中心等部门，是上海市神经外科研究所和中国人民 神经外科研究所所在单位。目前拥有床位180张（ICU40张），年门诊量10000人次，年手术量已达2000余台次（含DSA手术），在颅脑创伤、颅内肿瘤、脑血管病和功能神经外科等方面取得了丰硕的成果，形成了稳定的学术发展方向，整体上达国内先进水平，部分领域达国际领跑和国内领跑水平。
3、器官移植中心：器官移植中心于2003年初由泌尿外科肾移植组与普通外科肝移植组合并而成，同年12月17日被 总后勤部批准为中国人民 前列家器官移植研究所，是军队器官移植专业十分优等别的医教研集合体。开设有肝移植、肾移植、肝脏外科、胰岛移植门诊。设有组织配型、器官保存、动物实验、移植免疫、移植病理、胰岛移植等6个实验室。器官移植研究所在成人肝移植、成人肾移植、小儿肝移植、小儿肾移植、活体肝移植、活体肾移植、肝肾联合移植、胰肾联合移植等领域均有较快的发展。
