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上海华山医院共设39个临床医技科室，是一个特色学科很多的医院，尤以神经内外科、皮肤科、手外科、中西医结合、传染病科、脊柱和关节外科、肾脏病科、泌尿外科、肾移植、胰腺外科、乳房外科、内分泌科、职业病和风湿科、颌面外科、影像医学和核医学、运动医学、康复医学为特长。
其中神经外科、手外科、中西医结合科、泌尿外科、神经内科、传染病学和抗生素、肾病科、心血管科、影像医学和核医学、普外科为国内重点学科。
临床神经医学、手外科为上海市领跑学科，神经外科、手外科被命名为上海市临床医学中心。
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穆雄铮主任医师
整形外科
擅长：整形外科、颅颌面外科、面部轮廓整形、面部年轻、眼眶整形、正颌及外伤修复、先天性眶距增宽症、颅缝早闭、面裂、骨纤维异常增生、半面短小症、反颌、唇腭裂、下颌角肥大、神经纤维瘤
上海华山医院
陈文钧主任医师
骨科
擅长：创伤骨外科，严重骨折，手术后骨愈合不良。如肘关节恐怖三联症，严重胫骨平台粉碎性骨折。
上海华山医院
黄延焱主任医师
老年病科
擅长：老年神经疾病及精神障碍，擅长老年脑血管疾病、帕金森病及老年痴呆的诊断和治疗；擅长老年抑郁症、焦虑症及躯体疾病伴发精神障碍的诊断及治疗。
上海华山医院
张玉主任医师
老年病科
擅长：擅长疑难、复杂、多病共存的消化系统疾病综合诊断和治疗，尤其老年常见及难治性疾病，包括：胃食管反流病、消化性溃疡、慢性胃炎、胃肠功能紊乱、胃肠道息肉及恶性肿瘤、肝脏、胆囊、胰腺疾病等
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