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petct存在一定的局限性，特别是在消化道肿瘤的病灶病变方面存在一定盲区，所以不能代替胃镜的检查。petct主要是影像学检查，对于实质性脏器比较好，胃病很好查胃镜，petct可以提示身体内异常的生长代谢部位，但是细菌的代谢也是异常升高的，即便petct提示胃内病变，也需要胃镜进一步明确取活检病理诊断的，采用胃镜检查不仅可以直观地发现病灶，同时还可以通过取组织检查来明确诊断。
由于胃是一个腔性器官，正常胃组织对18F-FDG有不同程度的生理性摄取，一些良性疾病如胃溃疡时胃对18F-FDG的摄取也有可明显增高，这些都可影响胃炎的检出，容易造成假阳性。
目前为止，胃炎诊断的金标准是胃镜结合黏膜活检，胃炎需做胃镜检查后才能确诊。胃镜下取活检，通过病理学检查明确病变性质，还需探测螺杆菌，明确其含量，此为关键性检查。胃镜下可见胃黏膜红肿或溃疡，部分患者黏膜发白或溃疡表面有白色胎样改变，周围有隆起的水肿，需做活检以排除胃癌。
萎缩性胃炎在胃镜下可见斑片状胃黏膜出血点，或胃黏膜苍白、变薄。而CT、MRI、petct等检查方法则主要用于当胃癌诊断后进一步排除有无胃周或其他远处部位转移的检查手段，在胃癌手术前、新辅助治疗前后或者术后随访中起到重要的作用。
petct只是一种影像学检查，就算发现了病变也无法进行活检，但胃镜就不同，胃镜不但能发现病变，还可以通过特有的通道进行病变黏膜的活检。
一般胃镜下发现可疑早癌，医生可以选择美蓝染色，让癌性病变着色，有助于指导活检部位，也可以借助放大胃镜，NBI（窄带成像技术），超声胃镜，激光共聚焦胃镜，这些能够帮助医生更仔细地观察细微病变，提高胃早癌的诊断率。
