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近年来PETCT的临床应用增多，原来单纯使用PET和CT进行诊断的病例的20-25%通过PETCT检查后，临床诊断和治疗的效果显着提高。国内有超过数十万例患者接受过PETCT检查，在临床应用中取得了较好的效果。无论国际还是国内，PETCT的临床价值都得到了医学界的首肯，接下来的工作是如何更好、更有效地在临床上使用PETCT。
PETCT本身除了价格较高外，由于正电子核种超短半寿期的特点，很多PETCT中心需要购买医疗用小型回旋加速器和相关化学合成系统，这就提高了医疗技术人员的技术要求，增加了PETCT中心整体的费用，这些成为了PETCT成像设备发展的很大问题，因此，PETCT制造商将PETCT产品系列化、多样化，满足不同层次医院、不同临床特点的需求，降低购买费用。
只有为肿瘤的早期诊断、疗效评价和治疗方案的确定，才需要购买肿瘤专用型PETCT，才能完全满足临床需要。如果是综合医院，除肿瘤患者外还有一部分心脏患者，医院较 好选择临床实用型的PETCT，这是因为心脏PETCT的采集必须采用2D采集方式。
另外，为了检测腹部和纵隔小的肿瘤病变，PETCT也需要采用2D采集方式，科学研究型PET都有2D和3D的采集方式，但两者各有优点，因为用户可以根据研究对象灵活选择。
科研型PETCT适应疾病的临床诊断，大型综合医院购买PETCT不仅仅是为了检查肿瘤患者，还建议购买科研型PETCT，应对各种疾病的临床诊断。
PETCT正以惊人的速度发展，但仍有许多问题需要解决，例如，更准确地进行3D收集的衰减校正的方法、由于PET和CT收集的速度的不同导致的PET和CT图像的准确的对准困难等问题是当前关注的研究课题。
